사 업 명
(54) 스마트 식품안전관리(R&D) (4031-314)
□ 사업 코드 정보
구분	회계	소관	실국(기관)	계정	분야	부문
코드	일반회계	식품의약품 안전처	식품의약품안전평가원		090	093
명칭	보건	식품의약안전
구분	프로그램	단위사업	세부사업
코드	4000	4031	314
명칭	과학적 안전관리 연구 및 허가심사 안전성 제고	식의약품 안전 연구개발	스마트 식품안전관리(R&D)
□ 사업 성격
신규	계속	완료	예비타당성 실시여부	총사업비 관리대상	총액계상 예산사업	사업소관 변경정보
2025예산 시 소관
	◯
□ 사업 지원 형태 및 지원율
직접	출자	출연	보조	융자	국고보조율(%)	융자율 (%)
		◯
□ 사업 담당자
사업명	구분
스마트 식품 안전관리 (R&D)	소관부처	식품위해평가부
영양기능연구과
사업시행주체	한국보건산업진흥원

가. 예산 총괄표

(단위: 백만원, %)

사업명	2024년 결산	2025년 예산		2026년		증감 (B-A)
		본예산(A)	추경	요구	예산(B)		(B-A)/A
스마트 식품 안전관리(R&D)	5,371	3,749	3,749	3,349	3,149	△600	△16

□ 기능별(내역사업별) 예산 내역

(단위: 백만원)

	2024					2025							2026예산
	예산액 (추경)	예산 현액	집행액 [실집행액]	이월액	불용액	본예산	예산 현액	집행액 [실집 행액]	전년도 이월액 제외		이월액	불용액
									예산 현액	집행액 [실집행액]
○ 기능별 분류(합계)	5,371	5,371	5,371 [5,371]	-	-	3,749	3,749	3,749	3,749	3,749 [3,749]	-	-	3,149
․생산·유통단계 식품안전 관리 시스템 개발 연구	3,760	3,760	3,760 [3,760]	-	-	1,450	1,450	1,450	1,450	1,450 [1,450]	-	-	1,500
․스마트 수입식품 안전관리 개발연구	512	512	512 [512]	-	-	800	800	800	800	800 [800]	-	-	-
․빅데이터 기반건강기능식품 등 적정섭취기반 구축	799	799	799 [799]	-	-	949	949	949	949	949 [949]	-	-	999
․(다부처)농생명 마이크로바이옴 혁신기술기반 구축	300	300	300 [300]	-	-	550	550	550	550	550 [550]	-	-	650

나. 사업설명자료

1) 사업목적·내용

- (스마트 식품 안전관리(R&D) 4차 산업혁명기술 등 차세대 신기술 이용 생산·유통·소비·수입 단계의 식품안전관리 기술 마련 및 건강기능식품 적정 섭취 기반 구축

- (생산·유통 단계 식품안전관리 시스템 개발 연구) 동 내역사업은 식품 생산 및 유통단계에서의 안전 및 품질보증 등을 관리할 수 있는 기술을 개발하기 위해 식품산업 현장을 대상으로 차세대 신기술을 활용한 식품안전관리시스템 개발을 지원하는 것임

- (스마트 수입 식품안전관리 개발 연구) 동 내역사업은 미래형 수입식품 안전관리 체계를 마련하기 위해 인공지능, 빅데이터 등의 첨단기술을 활용하여 수입식품 안전 위해도 예측모형과 수입식품 안전 정보의 소비자 전달체계 개발 등을 지원하는 것임

- (빅데이터 기반 건강기능식품 등 적정섭취기반 구축) 동 내역사업은 개인별 건강기능식품 등 적정 섭취 환경 조성을 위해 기능성 원료 등 중복‧병용 섭취 시 안전성 예측 기술 및 빅데이터 기반 개인 맞춤 적정섭취 평가기술 개발 등을 지원하는 것임

- (농생명마이크로바이옴 혁신기술기반 구축) 동 내역사업은 차세대 바이오산업의 핵심기술인 농생명 마이크로바이옴 유래 실물자원의 안전성 제어 및 산업화 지원을 위한 안전성 평가‧검증 시스템 개발 등을 지원하는 것임

2) 사업개요

□ 사업근거 및 추진경위

① 법령상 근거 및 조항

-「식품·의약품 등의 안전 및 제품화 지원에 관한 규제과학혁신법」제7조(연구개발사업추진)

-「식품·의약품 등의 안전 및 제품화 지원에 관한 규제과학혁신법」제8조(출연금)

-「농업ㆍ농촌 및 식품산업 기본법」제35조(농업 생산기반의 정비), 제36조(농업 및 식품 관련 산업의 기술개발 추진)

-「농림식품과학기술육성법」제6조(연구개발사업의 추진)

② 추진경위

- (‘22년도 국가연구개발 투자방향) 국정과제 및 현안대응을 위한 R&D투자 지속․강화

- (제2차 식품․의약품 등의 안전기술 진흥 기본계획(‘21~’25)) 4대 핵심전략 중 뉴노멀시대 데이터 기반 식·의약 스마트 안전관리에 대한 세부 전략으로 ‘첨단 ICT 기술을 활용한 전주기 스마트 식품안전관리 기술개발’, ‘블록체인·빅데이터 기술 활용 의료제품 안전관리 기술 개발’, ‘ 혁신적 안전관리를 위한 식·의약 빅데이터 플랫폼 구축’ 제시

- 규제샌드박스 “개인맞춤형 건강기능식품* 시범사업“ 관련 보도자료(‘20.4.27)

* 개인 맞춤형 시장 확대 추세를 반영하여 건강기능식품을 대상으로 시범 운영하는 것으로 개인의 건강상태, 식습관, 소비자 직접의뢰(DTC) 유전자 검사 결과 등을 검토하여 보충이 필요한 영양소 등을 고려하여 건강기능식품을 추천, 소분·판매하는 서비스(금지된 소분·판매를 규제샌드박스로 2년간 시범 운영)

- 규제 실증특례사업(융복합(融複合) 건강기능식품)* 규제특례심의위(산자부 주관) 의결(‘21.9.15)

* 건강기능식품(정제, 캡슐)과 식품(액상)을 한 번에 섭취할 수 있도록 일체형으로 포장한 제품

** 신청업체 : 풀무원녹즙, CJ제일제당, 에이치와이, 매일유업, 뉴트리원, 그린스토어

- 영양·건강기능식품(푸드테크) 분과 산업체 간담회(‘22.4.22)

* 맞춤 영양관리, 건강관리서비스 위해 빅데이터 기반 평가기술 국가 지원 필요성 강조

** 과잉, 중복/병용 섭취로 인한 우려를 해소하고, 적정 섭취를 유도할 수 있는 빅데이터 기반의 정보제공, 평가기술과 관련된 알고리즘 가이드라인 등 필요성 강조

- 제3차 생명공학육성기본계획(20~’25) 수립(’17.9., 관계부처 협동)시 미래 유망기술 분야로 마이크로바이옴 선정

- 그린바이오 융합형 新산업 육성방안(’20.9., 관계부처 합동)의 5대 산업기반(마이크로바이옴) 산업 생태계 조성 목표

- 국가 마이크로바이옴 혁신전략(’21.12., 과기부)

* (마이크로바이옴 연구개발 혁신) 다양한 분야에 활용되어 연구과정을 혁신할 수 있는 공통기반 기술과 동시에 인간, 동·식물, 산림, 환경 등 분야별 혁신 가속화를 위한 핵심기술을 확보

** (마이크로바이옴 신산업 촉진) 중장기·체계적 지원을 위한 법제도 기반을 마련하고, 시험 생산지원 인프라 구축·제공 및 신기술의 시장 진입과 해외진출을 지원

*** (마이크로바이옴 발전 생태계 조성) 국가 마이크로바이옴 빅데이터를 구축·활용하고, 부처별로 운영중인 연구 인프라에 대한 통합창구를 마련하는 한편, 마이크로바이옴 특화 전문인력을 양성

- 국가 전략기술 운영방안(’22.10., 과기부)의 12대 국가전략기술 중 첨단바이오 분야에 마이크로바이옴 포함

- 그린바이오 산업 육성전략(’23.2., 농식품부)

- 마이크로바이옴 R&D는 예타 미시행(’22.6.) 확정 후, 인체 마이크로바이옴은 예타 사업으로, 타 분야는 부처별 단기사업 형태로 추진

* 농축산분야(식품, 동·식물)는 농식품부·농진청이 공동으로 다부처 공동기획(’22.12.~’23.3.) 추진

□  주요내용

① 사업규모

- 총사업비 : 해당없음

- 사업기간 : 2021 ~ 2028

- 최근 5년 간 투입된 사업비

(단위: 백만원)

연도	2022	2023	2024	2025	2026
사업비	5,800	6,550	5,371	3,749	3,149

② 사업추진체계

- 사업시행방법 : 출연

- 사업시행주체 : 식품의약품안전처(전문기관: 한국보건산업진흥원)

- 사업 수혜자 : 민간

- 보조, 융자, 출연, 출자 등의 경우 보조․융자 등 지원 비율 및 법적근거

내역사업명	구분	피보조․피출연 등 기관명	지원 금액 (2026예산)	지원 비율(%)	보조율 법적근거 (해당 조항)
생산·유통 단계 식품안전관리 시스템 개발 연구	출연	대학, 출연연 등 비영리기관	1,500백만원	100	⦁식품·의약품 등의 안전 및 제품화 지원에 관한 규제과학혁신법 제8조제1항 ⦁국가연구개발혁신법 제13조제1항 및 동법 시행령 제19조제3항
		대기업, 공기업		50
		중견기업		70
		중소기업		75
빅데이터 기반 건강기능식품 등 적정섭취기반 구축	출연	대학, 출연연 등 비영리기관	999백만원	100
		대기업, 공기업		50
		중견기업		70
		중소기업		75
농생명 마이크로바이옴 혁신기술기반 구축	출연	대학, 출연연 등 비영리기관	650백만원	100
		대기업, 공기업		50
		중견기업		70
		중소기업		75

3) 2026년도 예산 산출 근거

① 생산·유통단계 식품안전관리 시스템 개발 연구

: (‘25) 1,450백만원 → (’26) 1,500백만원, 50백만원 증액

- (요구) 차세대 신기술을 이용한 안전관리 시스템 개발 등 계속 지원을 위해 1,500백만원 요구

- (산출) 건강기능식품 기능성 원료 스마트 제품화 지원 연구 등 2과제 1,500백만원

* 계속 2과제 × 750백만원 × 12/12 = 1,500백만원

② 스마트 수입 식품안전관리 개발 연구

: (‘25) 800백만원 → (’26) 0백만원, 순감

- (요구) 인공지능, 빅데이터 등 첨단기술을 활용한 수입식품 안전관리 기술개발 연구의 종료에 따라 순감

- (산출) -

③ 빅데이터 기반 건강기능식품 등 적정섭취기반 구축

: (‘25) 949백만원 → (’26) 999백만원, 50백만원 증액

- (요구) 건강기능식품 섭취 안전성 예측 및 적정섭취 평가기술 개발을 위해 999백만원 요구

- (산출) 기능성원료 등 중복/병용섭취 안전성 예측기술 개발·적용 연구 등 2과제 999백만원

* 계속 2과제 × 500백만원 × 12/12 = 999백만원

④ (다부처)농생명 마이크로바이옴 혁신기술기반 구축

: (‘25) 550백만원 → (’26) 650백만원, 100백만원 증액

- (요구) 마이크로바이옴 기술이 적용된 식품원료 안전성 평가기술 개발을 위해 100백만원 요구

- (산출) 농생명 마이크로바이옴 평가‧검증 시스템 개발 연구 1과제 650백만원

* 계속 1과제 × 650백만원 × 12/12 = 650백만원

4) 사업효과

□ 사업영향, 산출물 성과지표 등

① 2022~2026년도 성과계획서 상 성과지표 및 최근 5년간 성과 달성도

		성과지표	가중치	성과분야	실적 및 목표치								측정산식 또는 측정방법	자료 수집 방법/ 출처
					구분	'22	'23	'24	'25	'26	'27	'28
①식·의약안전 정책연계율(%)			1	R&D	목표	70	71	71.5	72	72.5	72.5	72.5	(당해연도 정책 반영건수) / (정책제안건수) × 100	고시 개정 (안), 가이드라인 지침 등 정책 제안 관련 공문
					실적	70.1	71.4	71.6	-	-	-	-

② 성과지표 이외의 연도별 사업추진 경과 및 실적

2022	○ 생산·유통 단계 식품안전관리 시스템 개발 연구 -「Rapid On-Site Identification for Three Arcidae Species (Anadara kagoshimensis, Tegillarca granosa, and Anadara broughtonii) Using Ultrafast PCR Combined with Direct DNA Extraction」등 SCI급 학술지게재논문(8건) -「A Study on development of enhanced value-added smart sensors for smart HACCP activation」등 학술회의 발표(27건) -「융합 센서 이미지를 이용하여 객체에 존재하는 이물질을 탐지하는 방법, 장치 및 컴퓨터-판독가능 기록매체」등 특허출원(8건) -「DNA 주형 구리 나노입자 기반 FRET 센서 및 이를 이용한 표적 핵산 분자의 검출 방법」등 특허등록(3건) - 기능성원료 개별인정 대면 기술지원(지역별) 등 연구성과 기술지원(74건) -「이미·이취흡수제 중 Aldehyde scavenger 식품 모사용매 용출 시험법 개발」등 시험법 개발(14건) ○ 스마트 수입 식품안전관리 개발 연구 -「효율적 수입식품 검사를 위한 머신러닝 기반 부적합 건강기능식품 탐지 방법」등 학술회의 발표(13건) -「수입식품 제조공정 분석 방법 및 장치」특허출원(2건)
2023	○ 생산·유통 단계 식품안전관리 시스템 개발 연구 -「Rapid and Simultaneous Authentication of Six Laver Species Using Capillary Electrophoresis-Based Multiplex PCR」등 SCI급 학술지게재논문(29건) -「공유주방 기반의 주방 위생 및 안전 관리 장치 및 방법」등 특허출원(2건) -「유통배달과정 중 식품관리를 위한 스마트포장 안전기술 개발」등 시험법 개발 및 모니터링 15건 ○ 스마트 수입 식품안전관리 개발 연구 -「Development of an AI-integrated communication model system using mobile apps for imported food products」등 학술회의 발표(12건) -「Wi-Fi 환경에서 음원의 방향 및 세기에 따른 QoS 채널 접근 제어 방법」등 특허출원(2건) ○ 빅데이터 기반 건강기능식품 등 적정 섭취기반 구축 -「Biological Age As The Composite Indicator For Oxidative And Metabolic Stress」등 학술회의 발표(3건) -「코드 표준 데이터 변환 프로그램(Dataweaver)」등 저작권(소프트웨어) 등록
2024	○ 생산·유통 단계 식품안전관리 시스템 개발 연구 -「A Review on Gas Indicators and Sensors for Smart Food Packaging」등 SCI급 학술지게재논문(28건) -「냉장/냉동 통합센싱장치 및 이를 구비한 스마트 HACCP 관리 시스템」특허 출원(12건) -「고농도 균주에 대한 휘발성 항균물질의 항균력 측정방법」특허 등록(5건) - 기능성원료 개별인정 대면 기술지원 등 연구성과 기술지원(80건) -「건강기능식품 개발자를 위한 인체적용시험 설계가이드」등 가이드라인 제·개정(1건) -「Real-time PCR을 이용한 축종별 유제품류 7종 판별법」등 시험법 개발(8건) ○ 스마트 수입 식품안전관리 개발 연구 -「Consumer Usability Test of Mobile Food Safety Inquiry Platform Based on Image Recognition」등 SCI급 학술지게재논문(28건) -「조회 빈도에 기반한 키워드 추천 시스템 및 그 방법」등 특허출원(2건) -「Usability evaluation of a user-friendly smartphone-based communication system integrated with detection algorithms for conveying the information of imported food products」등 학술회의 발표(6건) ○ 빅데이터 기반 건강기능식품 등 적정 섭취기반 구축 -「사용자 건강 상태와 생활 습관에 기반한 건강 상태 판정 및 맞춤형 건강 기능 식품 추천 시스템과 그 방법」특허 출원 -「From data to new technologies: Harnessing multiomics forcutting-edge functional assessment techniques」등 학술회의 발표(13건)
2025	○ 생산·유통 단계 식품안전관리 시스템 개발 연구 -「Development of a Species-Specific Real-Time PCR Analysis Method for the Identification of the herbal Plant Artemisia princeps and the Toxic Plant Corydalis speciosa」등 학술회의 발표(6건) -「Development of molecular markers for distinguishing between the edible plant Petasites japonicus and the toxic plant Farfugium japonicum using quantitative real time polymerase chain reaction」SCI급 학술지게재논문 ○ 스마트 수입 식품안전관리 개발 연구 -「Application of machine learning prediction models and large language models to enhance safety management of imported food」학술회의 발표 ○ 빅데이터 기반 건강기능식품 등 적정 섭취기반 구축 -「Unlocking the Poteintion of Multiomics For Next-Gen Functonal Food Science : Innovations in Precision Nutrition and Health Assesment」등 학술회의 발표(3건) ○ (다부처)농생명 마이크로바이옴 혁신기술기반 구축 -「Effects of Kefir Consumption on Gut Microbial Diversity in a Healthy Young Population」등 학술회의 발표(10건)

③ 향후(2026년도 이후) 기대효과

- 생산·유통 단계별로 데이터가 입력되고 검증되는 시스템 구축을 통해 식품 이력추적 안정화, 안전관리 체계 완성도 및 안전한 먹거리 제공에 대한 국민 신뢰도 향상(제안 대비 정책채택률 29.3% 이상)

- 빅데이터 등 첨단기술을 활용하여 수입식품에 대한 제도적‧기술적 정보 기반 미래형 관리 및 소비자를 위한 첨단 안전 정보 전달 방식 실현(특허 등록지수 4.85점 이상)

- 개인 맞춤 적정 섭취 평가기술 개발 보급을 통해 대상자별 맞춤 건강기능식품 구매‧섭취 등 안전한 소비환경 조성 및 맞춤형 건강 기능식품 시장 확대(현장적용을 위한 가이드라인 개발 1건 이상)

- 식품 마이크로바이옴 유래 실물자원의 안전성 평가 검증 시스템 확립을 통한 표준화, 평가 기준 확립 및 산업화 지원(안전성 평가·검증 가이드라인 개발 1건 이상)

5) 타당성조사 및 예비타당성조사 시행여부 및 결과 요지 : 해당없음

6) 총사업비 대상사업 여부 및 내역 : 해당없음

7) 사업 집행절차

< 절차도 >

사업계획 수립 (현장수요조사, 사전조사‧기획연구 등)									․식품의약품안전처(한국보건산업진흥원)
사업 공고									․한국보건산업진흥원
과제 평가 및 선정									․한국보건산업진흥원
연구 협약									․한국보건산업진흥원 - 연구개발기관
연구개발과제 수행									․연구개발기관
과제 단계･최종 평가									․한국보건산업진흥원
사업 평가									․(자체)식품의약품안전처(한국보건산업진흥원)/ (상위)과학기술정보통신부

* 관련법령: 국가연구개발혁신법, 같은법 시행령, 시행규칙 및 행정규칙, 식품·의약품 등의 안전기술 연구개발사업 운영규정

8) 각종 평가

2) R&D사업의 경우 「국가연구개발사업 등의 성과평가 및 성과관리에 관한 법률」제7조제3항에 따른 부처의 R&D사업 자체성과평가에 대한 과학기술정보통신부 상위점검 결과

: ‘25년도 국가연구개발사업 중간평가 상위점검 최종결과 ’적절‘로 자체평가 결과 인정(자체평가 : 보통)

다. 최근 4년간 결산내역

1) 결산표

□ 부처 결산내역

(단위: 백만원, %)

연도	예산액			전년도 이월액	이․전용 등	예비비	예산 현액(B)	집행액 (C)	집행률 (C/A)	집행률 (C/B)	다음연도 이월액	불용액
	본예산	추경 증감액	추경(A)
2022	5,800	-	5,800	-	-	-	5,800	5,800	100	100	-	-
2023	6,500	-	6,500	-	-	-	6,500	6,500	100	100	-	-
2024	5,371	-	5,371	-	-	-	5,371	5,371	100	100	-	-
2025	3,749	-	3,749	-	-	-	3,749	3,749	100	100	-	-

□ 출연·보조사업 등 실집행내역

(단위: 백만원, %)

구분	부처			사업시행주체(피출연․피보조 기관 등)
	예산액		집행액	교부액	전년도 이월액	교부 현액	집행액 (B)	이월액	불용액	실집행률 (B/A)
	본예산	추경(A)
2022	5,800	5,800	5,800	5,800	-	5,800	5,800	-	-	100
2023	6,500	6,500	6,500	6,500	-	6,500	6,500	-	-	100
2024	5,371	5,371	5,371	5,371	-	5,371	5,371	-	-	100
2025	3.749	3.749	3.749	3.749	-	3,749	3,749	-	-	100

2) 주요 결산사항 : 해당없음